Dans Days Gone, vous incarnez Deacon St. John, un vagabond et mercenaire prêt à accepter toutes les missions, qui parcourt le nord-ouest pacifique post-apocalyptique, probablement dans l'Oregon, l'état de résidence du développeur de Days Gone, SIE Bend Studio. Les survivants de la région ont construit des camps à travers la forêt sauvage et chaque camp est accompagné de son chef plutôt excentrique. Deacon n'a aucun désir de se joindre à l'un de ces camps, choisissant plutôt de vivre la vie d'un nomade avec son dernier ami Boozer. Cela dit, Deacon se rendra régulièrement dans ces camps pour acheter des fournitures, améliorer sa moto et prendre des emplois auprès des divers membres du camp. Days Gone se déroule environ deux ans après qu'une épidémie virale ait tué des millions de personnes à travers les États-Unis et en a transformé beaucoup d'autres en Freakers, des zombies en mouvement qui se nourrissent de chair humaine. Le nord-ouest Pacifique est maintenant rempli de ces monstres qui préfèrent chasser la nuit et hiberner le jour. Cependant, les Freakers ne sont pas la seule chose à surveiller. Il existe également des factions rivales, telles que les Rippers et les Marauders, lourdement armées et résolues à convertir ou à prendre en embuscade les personnes se présentant à eux.