Le nouveau boîtier Apple TV embarque le système d'exploitation iOS 4.1, le même qui équipe les iPad ou les iPhone 4. Par conséquent, certains développeurs ont déjà réussi à contourner les protections du système en se basant sur la faille Shatter présente dans l'OS, une vulnérabilité toujours pas corrigée par Apple. De ce fait, les futures clients d'Apple TV pourraient télécharger des applications tierces ou des fonctionnalités annexes normalement pas autorisées par la firme de Cupertino.